Hebra sencilla de un fragmento de DNA o de RNA, utilizada en ingeniería genética para buscar un gen particular o una secuencia determinada de DNA. La sonda consiste en una secuencia de bases complementaria de la que se busca, y a la que se unirá por unión de los pares de bases. Si previamente hemos marcado la sonde con un isótopo radiactivo, éste puede identificarse posteriormente tras la adecuada separación y purificación de la muestra. Hay sondas de tamaños variables, pudiendo construirse en laboratorio hasta de 100 nucleótidos, son utilizadas en la técnicas de Southern blotting para identificar fragmento particulares de DNA, como para diagnosticar anomalías genéticas en combinación con un mapa genético de restricción.