La substancia antivírica que se usa en la prevención o el tratamiento de las infecciones por citomegalovirus que pueden manifestarse cuando el sistema inmunitario está deprimido. En la terapia génica, el ganciclovir se usa con un gen modificado del virus del herpes simple tipo 1 para eliminar las células de melanomas y las células de tumores cerebrales en estadio avanzado.