La fusión de células sexuales masculinas y femeninas de diferentes individuos de una misma especie.
En biología, la fecundación cruzada es necesaria en especies animales y vegetales que tienen órganos sexuales masculinos y femeninos en individuos separados. En los animales hay diversos métodos de fecundación cruzada. En la mayoría de las especies que se reproducen en el agua, los machos y hembras depositan sus células sexuales en ese medio, donde la fecundación ocurre fuera del cuerpo. En las criaturas terrestres, la fecundación es interna y los espermios son introducidos en el cuerpo de la hembra. La fecundación cruzada, al recombinar el material genético de dos progenitores, mantiene un margen mayor de variabilidad para que obre la selección natural, aumentando con ello la capacidad de adaptación de una especie a los cambios ambientales.
En botánica, la fecundación que se realiza entres especies distintas. En algunas ocasiones, este tipo de fecundación debe ser interpretado como un caso de activación en el que el agente activante es el espermatozoide, y en realidad el desarrollo es apomíctico; véase autofecundación (F. Q.).