Dícese de cada uno de los que, procediendo de sendos gámetas, constituyen pareja en el zigoto y en todas las células somáticas del organismo que derivan de aquél. Los cromosomas completamente homólogos tiene exactamente la misma estructura, los mismo cromómeros y la misma secuencia. Claro es que falta de homología en una pequeña región no impide que califiquemos de homólogos los dos cromosomas del par; pero en la meiosis esas pequeñas diferencias son trascendentales, porque tales regiones no llegan a acoplarse.