Intercambio de segmentos cromosómicos entre dos de las cuatro cromátidas acopladas en la prófase de la meiosis; suponiendo que los dos cromosomas homólogos acoplados tengan los genes ABCDEFG y abcdefg, el resultado del entrecruzamiento en el segmento medio será; una cromátida con ABCDEFG. otra con ABcdeFG, otra con abCDEfg y otra con abcdefg. Las dos nuevas combinaciones ABcdeFG y abCDEfg, que no existían en la primitivas razas, son recombinaciones o nuevas combinaciones. El cociente que resulta de dividir el número de gámetas con recombinaciones por el número total de gámetas que ha dado una generación, constituye la frecuencia de recombinación. El valor del entrecruzamiento es igual a la frecuencia de recombinación cuando se trata de cruzamientos de retorno; pero no lo es si los cruzamientos son de F1 x F1. El entrecruzamiento modifica las asociaciones de factores en los cromosomas, y por tanto, aumenta mucho la variabilidad genética. Sin él, los cromosomas tendrían siempre los mismos genes (excluyendo la mutación, es claro), mientras que con el entrecruzamiento las combinaciones de genes en cada cromosoma cambian siempre de una a otra generación. La explicación del entrecruzamiento, debida a Th. H. Morgan, se basa en la distribución lineal de los genes en lugares fijos y determinados, a lo largo del cromosoma. La moderna teoría de la quiasmotipia parcial admite que los puntos donde se ha producido el intercambio de segmentos muestren después los quiasmas o figuras cruzadas en que se atraviesan dos de las cuatro cromátidas acopladas. Así los quiasmas son el resultado del entrecruzamiento. Esta teoría de la quiasmotipia parcial tiene actualmente aceptación general. En fenómeno de entrecruzamiento es la base de los mapas cromosómicos. Las distancias que se marcan entre los genes son los valores del entrecruzamiento obtenidos en determinadas condiciones de cultivo y de ambiente, en general. Los valores de dicho mapa se indican en porcentajes; así, una distancia de 10,0 significa que los dos genes situados a esta distancia tienen entre sí un porcentaje de entrecruzamiento igual a 10. Estas distancias sólo son definitivas cuando son pequeñas, porque si la distancia es grande puede haber entrecruzamiento doble, esto es, dos entrecruzamiento seguidos en la región considerada, y entonces el número de recombinación disminuye.