El gran grupo de genes que codifican varios componentes del sistema inmunitario, incluyendo el antígeno de histocompatibilidad y el componente del sistema complemento (CMH). En el hombre, el complejo mayor de histocompatibilidad está localizado en el cromosoma 6, e incluye al sistema HLA. Otras especies de vertebrados tienen región CMH similar. Ciertos genes del CMH pueden tener muchos alelos diferentes, lo que determina una gran diversidad de antígeno en la población, en la que cada individuo tiene un juego único y particular.